化学和生物分子格式

Wolfram 语言能导入和导出在化学、分子生物学和生物信息学中常用的标准格式,还可处理所有的分子类型和基因组大小的数据集.

参考资料参考资料

化学格式

"XYZ" XYZ 分子几何文件 (.xyz)

"MOL" MDL MOL 格式 (.mol)

"MOL2" Tripos MOL2 格式 (.mol2)

"SDF" MDL SDF 格式 (.sdf)

"SMILES" SMILES 化学格式 (.smi)

"HIN" HyperChem 分子数据格式 (.hin)

"JCAMP-DX" 化学光谱格式 (.jdx, .dx, .jcm)

生物信息学格式

"GenBank" NCBI GenBank 序列格式 (.gb, .gbk)

"FASTA" DNA、RNA 和氨基酸序列格式 (.fasta, .fa, .fsa, .mpfa)

"FASTQ" 具有基本质量的 DNA 和 RNA 序列格式 (.fastq, .fq)

"NEXUS" NEXUS 种系(phylogenetic)数据格式(.nex, .ndk)

"AgilentMicroarray" 微阵列(microarray)数据格式 (.txt)

"Affymetrix" 微阵列(microarray)数据格式 (.cel, .cdf, .chp, .gin, .psi)

"SFF" DNA 序列的 flowgram 格式 (.sff)

分子生物学格式

"PDB" 蛋白质数据银行格式 (.pdb)

"MMCIF" MMCIF 3D 分子模型格式 (.cif)

"FCS" 流式细胞计量数据格式 (.fcs, .lmd)

普通元素

"StructureDiagram" 化学结构图解

"Graphics3D" 3D 分子图形

"VertexCoordinates" 原子的 3D 坐标轴

"Sequence" 以对或氨基酸为基础的序列

"Elements" 所有可用元素