GapPenalty

GapPenalty
SequenceAlignment 和相关函数的一个选项,给出对应于插入和删除的每个空位相关的额外消耗.

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  • 在每次插入和删除需要对齐序列时,GapPenalty->p 指定序列相似度应减去一个数量 p.

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基本范例  (2)基本范例  (2)

默认情况下,用两个空位间找到一个对齐:

In[1]:=
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Out[1]=

增加空位罚分,可以促使用较少的空位形成的另一种对齐:

In[2]:=
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Out[2]=

默认对齐分数:

In[1]:=
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Out[1]=

增加空位的额外罚分:

In[2]:=
Click for copyable input
Out[2]=
2008年引入
(7.0)