GenomeLookup

GenomeLookup["seq"]
ヒトゲノム参照におけるDNA配列 seq と完全にマッチする位置を返す.

GenomeLookup["seq",n]
最高で n 個のマッチを返す.

詳細詳細

  • 配列はC またはCを含む文字列として表される.
  • GenomeLookup["seq"]が返す位置はの形式で与えられる.ただし,は染色体指定,strandあるいはは始まりと終りの位置である.
  • ヒト染色体は等で指定される.
  • 塩基は指定されたストランドの5'から3'の方向で番号を付けられる.
  • GenomeLookup[spec,"Count"]は完全なマッチの数を返す.

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ヒトゲノム上のDNA配列の一部の位置を求める:

In[1]:=
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Out[1]=

マッチする数を得る:

In[1]:=
Click for copyable input
Out[1]=

最初の10個のマッチを得る:

In[1]:=
Click for copyable input
Out[1]=
2008年に導入
(7.0)