このユーザガイドは，Mathematica を外部プログラムとともに使う従来の2種類の方法に従って，2部で構成されています．最初は外部プログラムを「インストール」してMathematica 環境を拡張することにより，その機能がMathematica に組み込まれているかのようにするものです．これは，人気のある数多くのアプリケーションやツールによってサポートされる「プラグイン」の概念に似ています．2つ目はバックグラウンドで実行される演算エンジンとしてMathematica を呼び出すプログラムを作成するものです．

Javaクラスをロードして呼び出すことによってMathematica 環境を拡張する方法は，第1部で説明します．第1部は特別なプログラム技術を必要としないので，幅広い方々に興味を持っていただけることでしょう．そこで説明されている機能を使うのに，Javaプログラマである必要はないのです．J/Link をそのようにお使いになりたい場合は，1.1の「J/Link ベーシック」をお読みください．すぐにJ/Link を使い始めることができます．1.2の「高度なトピック」にもぜひ目を通してください．これはJ/Link に少し慣れてから精読されるとよいでしょう．1.3は便利なプログラムの例を提示しています．

第2部では演算にMathematica を使うJavaプログラムの書き方を説明します．第2部ではJ/Link をJava用のMathLink Developer Kitとして取り上げています．MathLink について多少の知識をお持ちであることを想定しています．MathLink はMathematica ブックの2.13で取り上げられています．

このマニュアルでは演算にMathematica を使うJavaプログラム，並びにJavaを呼び出すMathematica プログラムの作成を説明するのに「J/Link プログラミング」という言葉を使っています．文脈から，どちらを意味するかははっきりするはずです．