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GenomeLookup

GenomeLookup["seq"]
参考人类基因,返回明确匹配 DNA 序列 seq 的坐标。
GenomeLookup["seq", n]
返回最多 n 个匹配。
  • 字符串形式表示的序列包含 ATGCAUGC
  • GenomeLookup["seq"] 返回的坐标按照 {{"chr", strand}, {p1, p2}} 形式给出,其中 "chr" 是一个染色体指定,带是 +1-1p1p2 是起始和末端坐标。
  • 人类染色体由 "Chromosome1""ChromosomeX""Mitochondrion" 指定。
  • 基的编号是指定带的 5' 到 3' 方向。
  • GenomeLookup[spec, "Count"] 给出明确匹配的数的统计。
求出人类基因上一个 DNA 序列片断的坐标:
In[1]:=
Click for copyable input
Out[1]=
 
获得匹配的数量:
In[1]:=
Click for copyable input
Out[1]=
 
获得前 10 个匹配:
In[1]:=
Click for copyable input
Out[1]=
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