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SmithWatermanSimilarity

SmithWatermanSimilarity[u, v]
文字列またはベクトル u と v の間のSmith-Waterman類似度を表す数を返す．
  • SmithWatermanSimilarity[u, v]は要素 u と要素 v の間の最適な局所的並べ方を求め，1要素マッチの数を返す．
  • デフォルト設定のSimilarityRules->Automaticでは，2文字間の各マッチで全体の類似度スコアに1加えられ，ミスマッチ，挿入，削除があるとそれぞれ-1が加えられる．
  • オプションのGapPenaltyで，一続きの挿入や削除の際に類似度スコアから差し引くその他の費用が指定される．
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例   (2)
2つの文字列間のSmith-Waterman類似度：
In[1]:=
Click for copyable input
Out[1]=
 
2つのベクトル間のSmith-Waterman類似度：
In[1]:=
Click for copyable input
Out[1]=
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