Import/Export フォーマット

SMILES (.smi)

MIMEタイプ：chemical/x-daylight-smiles
SMILES化学形式．
化学分子の構造を表すのによく使われる．
SMILESはSimplified Molecular Input Line Entry Specificationの頭字語である．
化学情報アプリケーションおよび化学データベースの中で化学式を表すのに使用される．
ASCII形式．
線形表記法を使って，分子の結合性グラフを表示する．
複数の分子のデータが保管できる．
1980年代にArthur WeiningerとDavid Weiningerによって開発された．

ImportはSMILES形式の標準的なバージョンと異性体バージョンを読み込むことができる．

IMPORT

Import["file.smi"]は任意の数のSMILES文字列を含むファイルをインポートする．

Import["file.smi"]はSMILESデータを化学分子のグラフ構造を表す Mathematica 式のリストに変換する．

Import["file.smi", elem]はSMILESから指定の要素をインポートする．

Import["file.smi", {{elem₁, elem₂, ...}}]は複数の要素をインポートする．

インポートの形式はImport["file", "SMILES"]あるいはImport["file", {"SMILES", elem, ...}]を使って指定することができる．

Importについての完全で一般的な情報は，関数ページを参照のこと．

ImportString[string, "SMILES"]はSMILE文字列を式に変換する．

要素

一般的なImport要素：

	"Elements"	このファイルで有効な要素とオプションのリスト
	"Rules"	それぞれの要素とオプションの規則の完全リスト

ImportはSMILESから変換する際にデフォルトで"Rules"要素を使う．

データを表現する要素：

	"EdgeRules"	結合性データ（規則のリストとして与えられる）
	"EdgeTypes"	文字列のリストとして与えられる結合の型
	"FormalCharges"	"VertexTypes"で与えられる原子電荷
	"VertexTypes"	分子を構成するすべての原子あるいはグループ（通常，化学元素省略形のリストとして与えられる）