Mathematica 9 is now available
THIS IS DOCUMENTATION FOR AN OBSOLETE PRODUCT.
SEE THE DOCUMENTATION CENTER FOR THE LATEST INFORMATION.
Wolfram Mathematica Documentation Center
DOCUMENTATION CENTER SEARCH
New to Mathematica? Find your learning path »
Mathematica > コアとなる言語 > 文字列操作 > 配列アラインメントと比較 > 距離と類似度の測定 > SmithWatermanSimilarity >
Mathematica > データの操作 > 数値データ > 探索的データ解析 > 距離と類似度の測定 > SmithWatermanSimilarity >
Mathematica > データの操作 > 統計的データ解析 > 探索的データ解析 > 距離と類似度の測定 > SmithWatermanSimilarity >
MATHEMATICA 組込みシンボル関連項目 »|その他 »

SmithWatermanSimilarity

SmithWatermanSimilarity
文字列またはベクトル u と v の間のSmith-Waterman類似度を表す数を返す．
詳細
  • SmithWatermanSimilarityは要素 u と要素 v の間の最適な局所的並べ方を求め，1要素マッチの数を返す．
  • デフォルト設定のSimilarityRules->Automaticでは，2文字間の各マッチで全体の類似度スコアに加えられ，ミスマッチ，挿入，削除があるとそれぞれが加えられる．
  • オプションのGapPenaltyで，一続きの挿入や削除の際に類似度スコアから差し引くその他の費用が指定される．
例題すべて閉じる
例   (2)
2つの文字列間のSmith-Waterman類似度：
2つのベクトル間のSmith-Waterman類似度：
2つの文字列間のSmith-Waterman類似度：
In[1]:=
Click for copyable input
Out[1]=
 
2つのベクトル間のSmith-Waterman類似度：
In[1]:=
Click for copyable input
Out[1]=
バージョン 7 の新機能
Ask a question about this page  |  Suggest an improvement  |  Leave a message for the team
フォーマット:   HTML  |  CDF