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GraphML (.graphml)

GraphMLグラフデータ形式．
グラフの標準交換．
GraphMLはGraph Markup Languageから派生した頭字語である．
XMLベースの形式．
型付き，属性付き，有向・無向グラフを表す．
ネストしたグラフ，ハイパーグラフも保管できる．
ユーザ定義の辺，頂点のタイプをサポートする．
2001年にGraphML開発グループにより提案された．
  • ImportとExportはGraphML形式を完全にサポートする．
IMPORTとEXPORT
  • Importは指定のファイルに保管された，単独のGraphオブジェクトあるいはグラフのリストとして与えられたグラフをインポートする．
  • Exportは1つまたは複数のグラフの隣接行列あるいは辺情報をGraphML形式にエキスポートする．
  • Importは指定された要素をGraphMLファイルからインポートする．
  • Importは子要素をインポートする．
  • Importは複数の要素をインポートする．
  • インポートの形式はImportあるいはImportで指定することができる．
  • Exportは expr が要素 elem を指定するものとして扱って，GraphMLファイルを作成する．
  • Exportはそれぞれの が対応する を指定するものとして扱う．
  • Exportは指定されたオプションの要素が指定された値を取るものとして expr をエキスポートする．
  • Exportは規則を使ってエキスポートされるべき要素を指定する．
  • Import toとExportについての一般的な情報は，関数ページを参照のこと．
要素
"Elements"ファイル中の有効な要素とオプションのリスト
"Rules"それぞれの要素とオプションについての規則の完全リスト
"Options"オプション，属性，設定についての規則のリスト
  • データを表す要素：
"AdjacencyMatrix"辺情報（行列のリストとして与えられる）
"EdgeAttributes"辺属性（規則のリストとして表示される）
"EdgeLabels"辺ラベルを表す文字列のリスト
"EdgeRules"すべてのグラフの結合性データ（規則の配列として与えられる）
"Graph"ファイルに保管された最初のグラフ（Graphオブジェクトとして与えられる）
"Graphics"このファイルに保持された最初のグラフ（グラフプロットとして描画される）
"GraphicsList"グラフィックスオブジェクトのリストとして与えられる全グラフ
"GraphList"Graphオブジェクトのリストとして与えられる，全グラフ
"VertexAttributes"頂点の属性（規則のリストとして表示される）
"VertexCount"それぞれのグラフの頂点の数（整数のリストとして与えられる）
"VertexList"グラフオブジェクトとして描画される，ファイルに保管された全グラフ
  • Importは単純なGraphMLファイルにはを，複数のグラフのGraphMLファイルにはをデフォルトで使用する．
  • 複数のグラフを含むGraphMLファイルの要素指定：
"GraphNames"文字列のリストで与えられるグラフ名
elem,"name"で指定されるグラフの要素 elem
elem,nこのファイルの n 番目のグラフのデータ表現要素 elem
elem,{n1,n2,...}グラフ , , ...の要素 elem
elem,Allリストで与えられる，全グラフに対する要素 elem
オプション
  • 一般的なImportオプション：
ImageSizeAutomaticグラフを表示する画像の全体的な大きさを指定する
  • GraphMLからインポートする際は，Graphがサポートするすべてのオプションを与えることができる．一般的な設定を示す：
EdgeLabelsAutomatic辺に対するラベルとラベルの配置
EdgeWeightAutomatic辺の重み
VertexCoordinatesAutomatic頂点に対する中心座標
VertexLabelsAutomatic頂点に対するラベルとラベルの配置
VertexShapeAutomatic頂点のグラフィックスの形状
  • をインポートする際は，GraphPlotがサポートするすべてのオプションを与えることができる．一般的な設定は次の通りである：
DirectedEdgesAutomatic辺を有向矢印で示すかどうか
EdgeLabelingAutomatic辺に与えられたラベルを含むかどうか
EdgeRenderingFunctionAutomatic辺に明示的なグラフィックスを与える関数
VertexLabelingAutomatic頂点名をラベルとして示すかどうか
VertexRenderingFunctionAutomatic頂点に明示的なグラフィックスを与える関数
  • Graphオブジェクトからエキスポートする際，Mathematica グラフ属性値はしばしばCompressを使って文字列としてエキスポートされる．
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例   (7)
GraphMLファイルからグラフをインポートする：
GraphオブジェクトをGraphMLにエキスポートする：
グラフデータをGraphMLにエキスポートする：
エキスポートされたファイルからグラフをインポートする：
例題ファイルで利用可能なImport要素を示す：
このファイルから辺と頂点のラベルと連結規則をインポートする：
Graphオブジェクトとしてインポートする：
例題ファイルの辺の属性をインポートする：
グラフをインポートし，頂点ラベルを表示してプロットする：
GraphMLファイルからグラフをインポートする：
In[1]:=
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Out[1]=
 
GraphオブジェクトをGraphMLにエキスポートする：
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Out[1]=
 
グラフデータをGraphMLにエキスポートする：
In[1]:=
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Out[1]=
エキスポートされたファイルからグラフをインポートする：
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Out[2]=
 
例題ファイルで利用可能なImport要素を示す：
In[1]:=
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Out[1]=
 
このファイルから辺と頂点のラベルと連結規則をインポートする：
In[1]:=
Click for copyable input
Out[1]=
 
Graphオブジェクトとしてインポートする：
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Out[1]=
 
例題ファイルの辺の属性をインポートする：
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Click for copyable input
Out[1]=
グラフをインポートし，頂点ラベルを表示してプロットする：
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Click for copyable input
Out[1]=
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