多項式アルゴリズムは古典的な「計算機代数」の中核である．
Mathematica は古いものから最新のものまでWolfram Researchのメソッドを統合し，世界で最も幅広くて深い多項式アルゴリズムの網を持つ．注意深く調整された方策が自動的にアルゴリズムを最適化するため，大規模な多項式代数が多くの種類の計算とともに日常的に扱われる．
Reduce — 方程式および不等式の計を標準形に還元する
PolynomialMod — 多項式の係数を減らす
GaussianIntegers — ガウス(Gaussian)整数について操作を行う
MinimalPolynomial — 一般的な代数的数の最小多項式
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