GapPenalty

GapPenalty
SequenceAlignment 和相关函数的一个选项,给出与插入和删除的间隙相关的设置.

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  • 在每次插入和删除需要对齐序列时,GapPenalty->p 指定相似序列应减去一个数量 p.

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基本范例 (2)基本范例 (2)

默认情况下,在两个间隙间找到一个对齐:

In[1]:=
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Out[1]=

增加间隙的惩罚("penalty"),可以指定使用另一个具有较少的间隙的对齐:

In[2]:=
Click for copyable input
Out[2]=

默认对齐得分:

In[1]:=
Click for copyable input
Out[1]=

增加间隙的额外惩罚:

In[2]:=
Click for copyable input
Out[2]=
版本 7 的新功能
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