MATHEMATICA IMPORT/EXPORT 形式
Affymetrix (.cel，.cdf，.chp，.gin，.psi)
- ImportはAffymetrix CEL，CDF，CHP，GIN，PSI形式を完全にサポートする．
- Import["file"]は任意のAffymetrix CEL，CDF，CHP，GIN，またはPSIファイルからデータをインポートする．
-
- Import["file", elem]は指定の要素をインポートする．
- Import["file", {{elem1, elem2, ...}}]は複数の要素をインポートする．
- インポート形式はImport["file", "Affymetrix"]またはImport["file", {"Affymetrix", elem, ...}]で指定できる．
-
- Importについての一般的な情報は，関数ページを参照のこと．
- ImportStringはAffymetrixファイル形式ファミリをサポートする．
- 一般的なImport要素：
-
| "Elements" | このファイルで利用できる要素とオプションのリスト |
| "Rules" | 各要素とオプションの規則の完全リスト |
| "Options" | オプション，属性，設定の規則のリスト |
- 共通のデータを表す要素：
-
| "Data" | 強度値(CEL)，処理されたプローブセットデータ(CHP)，またはプローブセットの記録(CDF，PSI，GIN) |
| "ProbeSetNames" | 文字列のリスト形式のプローブセット名 |
- CDF，PSI，あるいはGINからインポートする際，Import["file", {"Data", probesetname}]は指定のプローブセットに対応する記録を返す．
- Importは全Affymetrixファイル形式に対してデフォルトで
要素を使用する．
- 共通のメタデータ要素：
-
| "Header" | 規則のリストとして与えられるメタ情報 |
- 内在するDAT画像ファイルについてのメタ情報を表す追加のCEL要素：
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| "PixelRange" | 各プローブ強度値に対応する画素数 |
| "DataErrors" | 強度値における誤差 |
| "Outliers" | 異常値であると考えられるプローブの座標のリスト |
- 追加のCDF要素：
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- 追加のCHP要素：
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| "DetectionStates" | 検出された遺伝子式状態で，値True，False，Indeterminateのリストとして与えられる |
| "DetectionSignificances" | 各検出状態に対応する  値 |
| "ProbePairs" | 各プローブセットの中のプローブ対の数 |
| "ProbePairsUsed" | 検出状態の推測に使われるプローブ対の数 |
| "Alleles" | 検出された遺伝子型 |
| "ConfidenceValues" | 各遺伝子型の信頼値 |
CELファイルから強度値のラスタをインポートしてプロットする：
CELファイルから完全なヘッダ情報をインポートする：
| Out[3]= |  |
CDFファイルから完全なヘッダ情報を読み取る：
| Out[1]= |  |
プローブセット名の最初のいくつかをインポートする：
| Out[2]= |  |
プローブセット名に関連付けられているデータをインポートする：
| Out[3]= |  |
プローブセット名，信号データ，検出状態をCHPファイルからインポートする：
| Out[1]= |  |
GINファイルから完全なヘッダ情報を読み取る：
| Out[1]= |  |
プローブセット名の最初のいくつかをインポートする：
| Out[2]= |  |
プローブセット名に関連付けられているデータをインポートする：
| Out[3]= |  |
PSIファイルからプローブセット名の最初のいくつかをインポートする：
| Out[1]= |  |
プローブセット名に関連付けられているデータをインポートする：
| Out[2]= |  |
異常値プローブの位置を示す：
| Out[1]= |  |
データから製造者の透かしを抽出し，画像として示す：
| Out[1]= |  |
バージョン 8 の新機能
