MATHEMATICA IMPORT/EXPORT 格式

MOL (.mol)

MIME 类型：chemical/x-mdl-molfile
MDL 分子模型文件.
用于化学信息应用程序以及用于存储和交换三维分子模型的网页.
纯文本表格格式.
代表一个单一的化合物.
存储原子坐标、化学键信息和元数据.
由 Elsevier Molecular Design Limited (MDL) 维护.

Import 与 Export 支持 MOL 格式的版本2.

Import 与 Export Import 与 Export

Import["file.mol"] 从一个 molfile 导入一个分子模型或结构图.
Export["file.mol", expr] 把一个分子模型参数导出至 molfile.
Import["file.mol"] 当读取一个三维分子模型时，给出一个 Graphics3D 对象；当导入一个分子的平面表示时给出矢量图形.
Import["file.mol", elem] 从一个 molfile 中导入指定的参数.
Import["file.mol", {elem, sub_a, sub_b, ...}] 导入一个子参数.
Import["file.mol", {{elem₁, elem₂, ...}}] 导入多个参数.
导入格式可以由 Import["file", "MOL"] 或 Import["file", {"MOL", elem, ...}] 指定.
Export["file.mol", expr, elem] 通过把 expr 作为指定参数 elem 创建一个 molfile.
Export["file.mol", {expr₁, expr₂, ...}, {{elem₁, elem₂, ...}}] 把每一个指定为相应的 .
Export["file.mol", expr, opt₁->val₁, ...] 导出具有指定值的指定选项参数的 expr.
Export["file.mol", {elem₁->expr₁, elem₂->expr₂, ...}, "Rules"] 使用规则指定要导出的参数.
Import 与 Export 的完整信息请见参考页.
ImportString 与 ExportString 支持 MOL 格式.

参数 参数

Import 的通用参数：

	"Elements"	该文件可用的参数和选项列表
	"Rules"	每个参数和选项的完整规则列表
	"Options"	选项、属性和设置的规则列表

图形参数：
"Graphics3D" 分子模型的三维渲染

"StructureDiagram" 二维结构公式
默认情况下，Import 对于包括三维分子模型的 molfile，使用参数，对于结构公式使用.
表示数据的参数：

	"EdgeRules"	连接数据，以规则列表的形式给出
	"EdgeTypes"	化学键类型，以字符串的列表形式给出
	"FormalCharges"	原子电荷，以整数的列表形式给出
	"MassNumbers"	同位素质量数
	"VertexCoordinates"	二维或三维原子坐标，一般以皮米为单位
	"VertexTypes"	所有组成分子的原子或基团，一般以化学元素的缩写列表表示