MATHEMATICA IMPORT/EXPORT 格式

SDF (.sdf)

MIME 类型：chemical/x-mdl-sdf
MDL 分子模型文件.
用于化学信息应用程序以及用于存储和交换三维分子模型的网页.
纯文本表格格式.
表示化合物的一个任意数.
存储原子坐标、化学键信息和元数据.
由 Elsevier Molecular Design Limited (MDL) 维护.

Import 与 Export 支持 SDF 格式的版本2.

Import 与 Export Import 与 Export

Import["file.sdf"] 从一个 SDF 文件中导入分子模型或结构图.
Export["file.sdf", expr] 把分子模型的参数导出到 SDF 文件.
Import["file.sdf"] 当读取一个三维分子模型时，给出一个 Graphics3D 对象；当导入一个分子的平面表示时给出矢量图形.
Import["file.sdf", elem] 从一个 SDF 文件中导入指定的参数.
Import["file.sdf", {elem, sub_a, sub_b, ...}] 导入一个子参数.
Import["file.sdf", {{elem₁, elem₂, ...}}] 导入多个参数.
导入格式可以由 Import["file", "SDF"] 或 Import["file", {"SDF", elem, ...}] 指定.
Export["file.sdf", expr, elem] 通过把 expr 作为指定参数 elem 创建一个 SDF 文件.
Export["file.sdf", {expr₁, expr₂, ...}, {{elem₁, elem₂, ...}}] 把每一个指定为相应的 .
Export["file.sdf", expr, opt₁->val₁, ...] 导出具有指定值的指定选项参数的 expr.
Export["file.sdf", {elem₁->expr₁, elem₂->expr₂, ...}, "Rules"] 使用规则指定要导出的参数.
Import 与 Export 的完整信息请见参考页.
ImportString 与 ExportString 支持 SDF 格式.

参数 参数

Import 的通用参数：

	"Elements"	该文件可用的参数和选项列表
	"Rules"	每个参数和选项的完整规则列表
	"Options"	选项、属性和设置的规则列表

Graphics 参数：

	"Graphics3D"	存储在文件中的所有分子模型的三维渲染
	"Graphics3D",n	第 n 个分子的三维渲染
	"StructureDiagram"	所有分子的二维结构公式

默认情况下，Import 对于包括三维分子模型的 SDF 文件，使用参数，对于结构公式使用.
表示数据的参数：

	"EdgeRules"	连接数据，以规则列表的列表形式给出
	"EdgeTypes"	化学键类型，以字符串的列表的列表形式给出
	"FormalCharges"	由给出的原子电荷
	"MassNumbers"	同位素质量数
	"VertexCoordinates"	二维或三维原子坐标，一般以皮米为单位
	"VertexTypes"	所有组成分子的原子或基团，一般以化学元素的缩写列表表示

Import["file.sdf", "EdgeRules"] 以规则列表的列表给出存储在文件中所有化合物的连接数据.
Export["file.sdf", {vertlist, coordlist}, {{"VertexTypes", 从原子类型规范以及二维或三维坐标中创建一个 SDF 文件.
元信息参数：
"Header" 存储在文件中的每个分子的头信息，以字符串的列表形式表示