化学・生体分子学形式
Wolfram言語は化学，分子生物学，生物情報学で使用される標準形式をインポートすることも，多くの場合はエキスポートすることも可能であり，ゲノムサイズのデータだけでなく，分子のタイプ全範囲を日常的に扱う．
化学形式
"XYZ" — XYZ分子配列ファイル(.xyz)
"MOL" — MDL MOL形式(.mol)
"MOL2" — Tripos MOL2形式(.mol2)
"SDF" — MDL SDF形式(.sdf)
"SMILES" — SMILES化学形式(.smi)
"HIN" — HyperChem分子データ形式(.hin)
"CML" — Chemical Markup Language (.cml)
"CDX" — ChemDraw Exchange形式(.cdx)
"CDXML" — ChemDraw Exchange XML形式(.cdxml)
"Cube" — Gaussian Cubeファイル(.cub)
"FCHK" — Formatted Checkpointファイル(.fchk)
"GaussianLog" — Gaussianログファイル(.log)
"JCAMP-DX" — 化学分光学形式(.jdx，.dx，.jcm)
生物情報学形式
"GenBank" — NCBI GenBank配列形式(.gb，.gbk)
"FASTA" — DNA，RNA，アミノ酸配列形式(.fasta，.fa，.fsa，.mpfa)
"FASTQ" — 塩基品質付きDNA，RNA配列形式(.fastq，.fq)
"NEXUS" — NEXUS系統発生学データ形式(.nex，.ndk)
"AgilentMicroarray" — マイクロアレイデータ形式(.txt)
"Affymetrix" — マイクロアレイデータ形式(.cel，.cdf，.chp，.gin，.psi)
"SFF" — DNA配列フローグラム形式(.sff)
分子生物学形式
"PDB" — Protein Data Bank形式(.pdb)
"MMCIF" — MMCIF 3D分子モデル形式(.cif)
"MMJSON" — MMJSON 3D分子モデル形式(.json)
"FCS" — フローサイトメトリーデータ形式(.fcs，.lmd)