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Wolfram言語 ＆ システムドキュメントセンター

BioSequenceQ[bioseq]

bioseq が有効なBioSequence式の場合はTrueを，それ以外の場合はFalseを返す．

BioSequenceQ[bioseq,spec]

bioseq が指定 spec と一致する有効なBioSequence式の場合はTrueを，それ以外の場合はFalseを返す．

BioSequenceQ[bioseq,spec1|spec2|...]

bioseq が speciのいずれかと一致する有効なBioSequence式の場合はTrueを，それ以外の場合はFalseを返す．

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BioSequenceQ

BioSequenceQ[bioseq]

bioseq が有効なBioSequence式の場合はTrueを，それ以外の場合はFalseを返す．

BioSequenceQ[bioseq,spec]

bioseq が指定 spec と一致する有効なBioSequence式の場合はTrueを，それ以外の場合はFalseを返す．

BioSequenceQ[bioseq,spec1|spec2|...]

bioseq が speciのいずれかと一致する有効なBioSequence式の場合はTrueを，それ以外の場合はFalseを返す．

詳細

  • 指定に使える可能な値には，"FullySpecified"，任意の"BioSequenceType"実体の正規名，両者を繋いだものがある．"ExtendedBioSequenceType"実体が定義されると，その正規名も指定に使うことができる．
  • 指定の可能な値には，"FullySpecified"，任意の"BioSequenceType"実体の正規名，両者を繋いだものがある．"ExtendedBioSequenceType"実体が定義された場合はその正規名を指定することもできる．"HybridStrand"および"SequenceCollection"を使って配列がハイブリッド鎖あるいは配列コレクションかどうかをそれぞれ調べることができる．
  • 次の表はこれらの指定の例である．
  • "DNA","RNA","Peptide",…配列が特定のタイプであることをチェックする
    "FullySpecified"縮重記号がないことをチェックする
    "FullySpecifiedDNA",…上記の両指定をチェックする
  • 指定のどの組合せもAlternativesと一緒に与えることができる．有効な配列は指定のいずれかがマッチすれば認識される．

例題

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例  (1)

式が有効なBioSequence式かどうかを確認する：

Wolfram Language code: BioSequenceQ[BioSequence["DNA", "AACTTCGCGTA"]]

スコープ  (10)

指定のタイプについて無効な文字を含むBioSequenceに対しては，BioSequenceQはFalseを返す：

Wolfram Language code: BioSequenceQ[BioSequence["DNA", "AACUUCGCGUA"]]

BioSequence以外の頭部を含む入力もFalseになる：

Wolfram Language code: BioSequenceQ["AACTTCGCGTA"]

BioSequenceのタイプに適した縮重記号は有効であると認識される：

Wolfram Language code: BioSequenceQ[BioSequence["DNA", "YCG"]]

"FullySpecified"指定は非縮重記号の検証だけを行う：

Wolfram Language code: BioSequenceQ[BioSequence["DNA", "YCG"], "FullySpecified"]
Wolfram Language code: BioSequenceQ[BioSequence["DNA", "TCG"], "FullySpecified"]

ペプチドの停止記号のように特定の意味がある記号は，特定の化学物質を参照していなくても完全に指定されているとみなされる：

Wolfram Language code: BioSequenceQ[BioSequence["Peptide", "."], "FullySpecified"]

BioSequenceのタイプを確認する：

Wolfram Language code: BioSequenceQ[BioSequence["DNA", "TCG"], "RNA"]
Wolfram Language code: BioSequenceQ[BioSequence["RNA", "UCG"], "RNA"]

BioSequenceが完全に指定されていることと特定のタイプであることを同時に確認する：

Wolfram Language code: BioSequenceQ[BioSequence["RNA", "CAU"], "FullySpecifiedRNA"]

タイプがない配列については任意の文字が有効である：

Wolfram Language code: BioSequenceQ[BioSequence[None, "ABC"]]

タイプがない配列は，決して完全に指定されない：

Wolfram Language code: BioSequenceQ[BioSequence[None, "ABC"], "FullySpecified"]

拡張タイプの配列を確認する：

Wolfram Language code: es = EntityStore["ExtendedBioSequenceType" -> <| "Entities" -> <| "HachimojiDNA" -> <| "Alphabet" -> {"C", "G", "T", "A", "B", "P", "S", "Z"}, "Caption" -> "Hachimoji DNA Sequence", "Icon" -> "DNA", "ComplementLetterRules" -> {"A"  "T", "C"  "G", "P"  "Z", "B"  "S"}, "BibliographicSource" -> ExternalIdentifier["DOI", "10.1126/science.aat0971"]|> |> |>]; EntityRegister[es]; BioSequenceQ[BioSequence["HachimojiDNA", "ACTB"]]
Wolfram Language code: BioSequenceQ[BioSequence["HachimojiDNA", "ACTX"], "HachimojiDNA"]
Wolfram Language code: BioSequenceQ[BioSequence["HachimojiDNA", "ACTB"], "FullySpecified"]
Wolfram Language code: BioSequenceQ[BioSequence["HachimojiDNA", "ACTB"], "FullySpecifiedHachimojiDNA"]

配列が有効なハイブリッド鎖であるかどうかチェックする：

Wolfram Language code: BioSequenceQ[BioSequence["HybridStrand", {"AAC", "GCU"}], "HybridStrand"]

配列が有効な配列コレクションであることを確認する：

Wolfram Language code: BioSequenceQ[BioSequence[{ BioSequence["HybridStrand", {"AAC", "GCU"}], "TTG"}], "SequenceCollection"]

配列がDNAまたはRNAのBioSequenceかどうかをテストする：

Wolfram Language code: BioSequenceQ[BioSequence["DNA", "CAGT"], "DNA" | "RNA"]
Wolfram Language code: BioSequenceQ[BioSequence["Peptide", "KGDEESLA"], "DNA" | "RNA"]

配列がペプチドまたは環状ペプチドかどうかをテストする：

Wolfram Language code: BioSequenceQ[BioSequence["Peptide", "KGDEESLA"], "Peptide" | "CircularPeptide"]
Wolfram Language code: BioSequenceQ[BioSequence["RNA", "GUAC"], "Peptide" | "CircularPeptide"]
Wolfram Research (2020), BioSequenceQ, Wolfram言語関数， https://reference.wolfram.com/language/ref/BioSequenceQ.html （2021年に更新）.

テキスト

Wolfram Research (2020), BioSequenceQ, Wolfram言語関数， https://reference.wolfram.com/language/ref/BioSequenceQ.html （2021年に更新）.

CMS

Wolfram Language. 2020. "BioSequenceQ." Wolfram Language & System Documentation Center. Wolfram Research. Last Modified 2021. https://reference.wolfram.com/language/ref/BioSequenceQ.html.

APA

Wolfram Language. (2020). BioSequenceQ. Wolfram Language & System Documentation Center. Retrieved from https://reference.wolfram.com/language/ref/BioSequenceQ.html

BibTeX

@misc{reference.wolfram_2026_biosequenceq, author="Wolfram Research", title="{BioSequenceQ}", year="2021", howpublished="\url{https://reference.wolfram.com/language/ref/BioSequenceQ.html}", note=[Accessed: 10-August-2026]}

BibLaTeX

@online{reference.wolfram_2026_biosequenceq, organization={Wolfram Research}, title={BioSequenceQ}, year={2021}, url={https://reference.wolfram.com/language/ref/BioSequenceQ.html}, note=[Accessed: 10-August-2026]}