SNP
SNP
関連するインタープリタ »参照ゲノムと標本母集団の間の一塩基多様性．
実体のサンプル
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特性
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Chromosome chromosome ChromosomePosition chromosome location EntityClasses entity classes EntityTypeList entity type list Gene gene standard name GeneLength gene length GenePosition gene location Locus locus Name name WeightedAlleleFrequencies weighted allele frequencies
詳細
- "SNP"実体はそれぞれ，一塩基多型，つまり標本母集団と参照ヒトゲノムの間の一塩基対の差を表す．
- "SNP"実体には，認識された参照ゲノムに対する変異だけが含まれるので，新たにリリースされた一塩基多型は含まれないこともある．"SNP"実体は人間についてのみ提供される．
- 特性の中には，"SNP"実体タイプ全体について使え，EntityValue["SNP",property]の形式を使って得られるものもある．そのような特性には以下が含まれる．
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"Properties" 使用できる特性のリスト "PropertyCanonicalNames" 使用できる特性の標準名 "SampleEntities" 使用できる実体のサンプルリスト（通常の長さは10） "SampleEntityClasses" 使用できる実体クラスのサンプルリスト（通常の長さは10） "EntityCount" 使用できる実体の数 "Entities" 使用できる実体のリスト "EntityCanonicalNames" 使用できる実体の標準名 "EntityClasses" 使用できる実体クラスのリスト "EntityClassCanonicalNames" 使用できる実体クラスの標準名 "PropertyClasses" 使用できる特性クラスのリスト "PropertyClassCanonicalNames" 使用できる特性クラスの標準名 "PropertyCount" 使用できる特性の数 - EntityValue["SNP",property,annotation]の第3引数として以下の注釈が使える．
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"Source" 特性の出典情報 "Date" 実体特性値に関連する日付（あれば） "EntityAssociation" 実体と実体特性値の連想 "PropertyAssociation" 特性と実体特性値の連想 "EntityPropertyAssociation" 指定の実体がキー，値が特性と実体特性値のネストした連想である連想 "PropertyEntityAssociation" 指定の特性がキー，値が実体と実体特性値のネストした連想である連想 "Dataset" 指定の実体がキー，値が特性名と実体特性値の連想であるデータ集合 - EntityValue[property,annotation]の第2引数として以下の注釈が使える．
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"Qualifiers" 特性の可能な限定子のリスト "QualifierValues" 各限定子に与えることができる値のリスト "DefaultQualifierValues" 特性の限定子のデフォルト値のリスト "Description" 特性についての短いテキストでの説明 "Definition" テキストでの特性についての詳しい説明 "PhysicalQuantity" 実体特性値に関連する物理量 "Unit" 実体特性値に関連する単位 - 限定子の値であるAutomaticは，適用できる形式の値が使えることを意味する．例えば，"Date"限定子には固有の日付や日付範囲が含まれる．
例題
例 (3)
実体を調べる際には，
を使う：
ある実体の特性値を求める：
ある実体について使用できる特性すべてのデータ集合を取り出す：