StereochemistryElements

StereochemistryElements

是 Molecule 的一个选项，指定分子中原子的局部立体化学排列.

更多信息

  • 选项值描述原子或键周围的局部几何，但并不指定绝对立体化学（例如，立体中心 "R" 或 "S"）.
  • StereochemistryElements 的值被用于产生二维结构图表和在三维中嵌入分子.
  • StereochemistryElements 选项的值可以通过 MoleculeValue，使用属性名 "StereochemistryElements" 从分子中获取.
  • 使用 "StereoType" 键，作为关联列表输入元素.
  • "StereoType" 的可能值为：
  • "Tetrahedral"用于原子立体中心
    "DoubleBond"用于不可旋转的键周围的几何异构
  • 对于 "Tetrahedral" 立体元素，支持以下键：
  • "ChiralCenter"手性中心的原子索引
    "FiducialAtom"键合手性中心的参考原子的索引
    "Ligands"键合手性中心剩下三个原子的索引列表
    "Direction""Clockwise" 或 "Counterclockwise"
  • 当配位原子沿着向量来看从基准原子到手性中心，它们的顺序是由指定的方向给定.
  • 手性中心可能有隐性氢，这样，"Ligands" 列表只能有两个原子，氢在列表的尾部.
  • 对于 "DoubleBond" 立体元素，支持以下键：
  • "StereoBond"两个原子索引的列表，它们之间有双键
    "Ligands"两个原子索引列表
    "Value""Together" 或 "Opposite"
  • 配体列表中的两个原子必须与双键中的两个原子键合.
  • 当值为 "Together"，两个配体在双键的同一边. "Opposite" 指定它们在相反的一边.
  • 对于具有不同立体化学的分子，MoleculeMatchQ 将返回 False .

范例

基本范例  (2)

创建带有手性中心的分子：

接下来创建它的对映体：

手性反映在 "SMILES" 和 "InChI" 标识符中：

创建双键周围有定义几何的分子：

接下来创建几何异构体：

几何反映在 "SMILES" 和 "InChI" 标识符中：

Wolfram Research (2019)，StereochemistryElements，Wolfram 语言函数，https://reference.wolfram.com/language/ref/StereochemistryElements.html.

文本

Wolfram Research (2019)，StereochemistryElements，Wolfram 语言函数，https://reference.wolfram.com/language/ref/StereochemistryElements.html.

CMS

Wolfram 语言. 2019. "StereochemistryElements." Wolfram 语言与系统参考资料中心. Wolfram Research. https://reference.wolfram.com/language/ref/StereochemistryElements.html.

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Wolfram 语言. (2019). StereochemistryElements. Wolfram 语言与系统参考资料中心. 追溯自 https://reference.wolfram.com/language/ref/StereochemistryElements.html 年

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