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CIF (.cif)

  • Import 支持 CIF 格式的 1.1版本.

背景

    • MIME 类型：chemical/x-cif
    • 三维分子模型文件.
    • 用于化学信息应用程序以及用于存储和交换分子模型的网页.
    • CIF 是 Crystallographic Information File（晶体学信息文件）与 Crystallographic Information Framework（晶体学信息架构）的缩写.
    • 纯文本格式.
    • 可扩展的自我描述格式.
    • 由国际晶体学联盟（International Union of Crystallography）1991年开发.

导入

  • Import["file.cif"] 读取 CIF 文件并以嵌套 Association 的形式返回它的内容.
  • Import["file.cif",elem] 从 CIF 文件中导入指定的参数.
  • Import["file.cif",{{elem1,elem2,…}}] 导入多个参数.
  • 导入格式可以用 Import["file","CIF"] 或 Import["file",{"CIF",elem,…}] 指定.
  • 请到以下参考页面了解完整的基本信息：
  • Import从文件导入
    CloudImport从云对象导入
    ImportString从字符串导入
    ImportByteArray从字节数组导入

导入参数

  • Import 通用参数：
  • "Elements" 该文件可用的参数和选项列表
    "Summary"文件摘要
    "Rules"所有可用参数的规则列表
  • 表示数据的参数：
  • "Data"数值和文本数据，以嵌套 Association 的形式给出
    "Comments"字符串列表形式的用户注释
    "Molecule"分子模型的象征性表示
  • 默认情况下，对 CIF 格式，Import 使用 "Data" 参数.
  • "CIF" 文件由一个或多个命名的数据块组成. 数据块的名称是导入的 Association 的键.
  • 每个数据块包含命名的数据条目，可以是数字、字符串或列表. 在 Wolfram 语言中，用 Association 表示每个块.
  • "CIF" 文件通常只有一个数据块.

范例

基本范例  (3)

导入一个 CIF 文件：

从 CIF 文件导入分子对象：

可视化 3D 分子：

将数据导出至 CIF 字符串：

将数据导回 Wolfram 语言：