WOLFRAM

Wolfram言語 ＆ システムドキュメントセンター

Atom["sym"]

原子記号"sym"の原子を表す．

Atom["sym",namevalue,…]

原子記号が"sym"で指定された特性を持つ原子を表す．

詳細
Details and Options Details and Options
例題  
例  
スコープ  
関連項目
関連するガイド
履歴
引用書式

Atom

Atom["sym"]

原子記号"sym"の原子を表す．

Atom["sym",namevalue,…]

原子記号が"sym"で指定された特性を持つ原子を表す．

詳細

  • Molecule式内の原子には，次の特性が指定できる．
  • "FormalCharge"0電子の形式電荷
    "MassNumber"None原子核の質量数
    "UnpairedElectronCount"0不対（ラジカル）電子
    "DisplayName"None原子のラベル．任意の文字列でよい
  • "MassNumber"特性がNoneのとき，分子量はElementDataにおける平均原子質量を使って計算される．質量数が指定されている場合は，質量はIsotopeDataから取られる．
  • Atomは，AtomListやMoleculeContainsQ等の関数に対して，分子内の単一の原子と対応させるパターンとして使うことができる．この場合は，追加的な計算された特性が指定できる．次は，よく使われるパターン特性とその値である．
  • "AromaticAtomQ"True|False
    "AtomChirality""R"|"S"
    "AtomicMass"Real
    "AtomicNumber"Integer
    "CIPRank"Integer
    "CoordinationNumber"Integer
    "FormalCharge"Integer
    "GasteigerPartialCharge"Real
    "GeometricStericEffectIndex"Real
    "HeavyAtomCoordinationNumber"Integer
    "HydrogenCount"Integer
    "ImplicitHydrogenCount"Integer
    "MassNumber"Integer
    "MMFFPartialCharge"Real
    "OrbitalHybridization""SP"|"SP3"…
    "OuterShellElectronCount"Integer
    "PiElectronCount"Integer
    "RingAtomQ"True|False
    "TopologicalStericEffectIndex"Real
    "UnpairedElectronCount"Integer
    "UnsaturatedAtomQ"True|False
    "Valence"Integer
  • GreaterThan，LessThan，GreaterEqualThan，LessEqualThanあるいはBetweenを使って数値特性が指定できる．

例題

すべて開く すべて閉じる

例  (2)

原子と結合で分子を構築する：

Wolfram Language code: Molecule[{"N+", Atom["O"], Atom["O", "FormalCharge" -> -1], Atom["O", "FormalCharge" -> -1]}, {Bond[{1, 2}, "Double"], Bond[{1, 3}, "Single"], Bond[{1, 4}, "Single"]}]

原子のリストを取り出す：

Wolfram Language code: AtomList[%]

原子と定義済みの質量数を使って分子を構築する：

Wolfram Language code: Molecule[{"O", Atom["H", "MassNumber" -> 2], Atom["H", "MassNumber" -> 2]}, {Bond[{1, 2}, "Single"], Bond[{1, 3}, "Single"]}]
Wolfram Language code: ToEntity[%]

スコープ  (3)

電子を1つ持つすべての原子をハイライトする：

Wolfram Language code: MoleculePlot[Molecule["pyridine-2,5-dicarboxylic acid"], {Atom[_, "PiElectronCount" -> 1]}]

大きい部分電荷を持つ分子をハイライトする：

Wolfram Language code: MoleculePlot[ Molecule[ExternalIdentifier["PubChemCompoundID", 4369091]], <|"δ -" -> Atom[_, "GasteigerPartialCharge" -> LessThan[-0.1]], "δ +" -> Atom[_, "GasteigerPartialCharge" -> GreaterThan[0.1]]|>, PlotLegends -> Placed[Automatic, Scaled[{.8, 0.8}]] ]

原子にラベルを付ける：

Wolfram Language code: MoleculePlot[Molecule[{Atom["H", "DisplayName" -> "SubscriptBox[R, 1]"], "O", "H"}, {Bond[{1, 2}, "Single"], Bond[{2, 3}, "Single"]}]]
Wolfram Research (2019), Atom, Wolfram言語関数， https://reference.wolfram.com/language/ref/Atom.html.

テキスト

Wolfram Research (2019), Atom, Wolfram言語関数， https://reference.wolfram.com/language/ref/Atom.html.

CMS

Wolfram Language. 2019. "Atom." Wolfram Language & System Documentation Center. Wolfram Research. https://reference.wolfram.com/language/ref/Atom.html.

APA

Wolfram Language. (2019). Atom. Wolfram Language & System Documentation Center. Retrieved from https://reference.wolfram.com/language/ref/Atom.html

BibTeX

@misc{reference.wolfram_2026_atom, author="Wolfram Research", title="{Atom}", year="2019", howpublished="\url{https://reference.wolfram.com/language/ref/Atom.html}", note=[Accessed: 14-August-2026]}

BibLaTeX

@online{reference.wolfram_2026_atom, organization={Wolfram Research}, title={Atom}, year={2019}, url={https://reference.wolfram.com/language/ref/Atom.html}, note=[Accessed: 14-August-2026]}