-
参见
- 函 数
- ServiceExecute
- ServiceConnect
-
- 服务连接
- ChemSpider
- PubChem
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参见
- 函 数
- ServiceExecute
- ServiceConnect
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- 服务连接
- ChemSpider
- PubChem
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参见
Open PHACTS
连接与验证
要求
化合物信息
"CompoundInformation" — 关于一个或者多个化合物的信息
| "URI" | (必须的) | 化合物 URI 或者 URI 的 List | |
| "InChI" | None | InChI 化合物识别符 | |
| "InChIKey" | None | InChIKey 化合物识别符 | |
| "SMILES" | None | SMILES 化合物识别符 |
化合物的类成员数目
"CompoundClassMembersCount" — 在支持的结构中用给定类别分类的化合物数目. 目前，唯一支持的结构是 ChEBI 本体.
| "URI" | (必须的) | 化合物 URI 或者 URI 的 List | |
| "InChI" | None | InChI 字符串 | |
| "InChIKey" | None | InChIKey 字符串 | |
| "SMILES" | None | SMILES 字符串 |
来自某化合物的类成员列表
"CompoundClassMembersList" — 在支持的结构中用给定类别分类的化合物列表. 目前，唯一支持的结构是 ChEBI 本体.
| "URI" | (必须的) | 化合物 URI 或者 URI 的 List | |
| "InChI" | None | InChI 字符串 | |
| "InChIKey" | None | InChIKey 字符串 | |
| "SMILES" | None | SMILES 字符串 | |
| "StartIndex" | 1 | 起始索引 | |
| MaxItems | 10 | 返回的元素数目 | |
| "SortBy" | None | 按照哪个变量排序 |
化合物的类别
"CompoundClassifications" — 给定化合物 URI 用来分类的类别. 目前支持的结构是 ChEBI Ontology 和 Gene Ontology.
| "URI" | (必须的) | 化合物 URI 或者 URI 的 List | |
| "InChI" | None | InChI 字符串 | |
| "InChIKey" | None | InChIKey 字符串 | |
| "SMILES" | None | SMILES 字符串 |
来自 InChI、InChiKey 或者 SMILES 的化合物 URI
"GetURI" — 对应于给定 InChI、InChIKey 或者 SMILES 字符串的 ChemSpider URI
| "InChI" | None | InChI 字符串 | |
| "InChIKey" | None | InChIKey 字符串 | |
| "SMILES" | None | SMILES 字符串 |
目标信息
"TargetInformation" — 一个或者多个目标的信息
| "URI" | (必须的) | 化合物 URI 或者 URI 的 List |
来自目标的类成员数目
"TargetClassMembersCount" — 在支持的结构中按照给定类别分类的目标数目. 目前支持的结构是 Enzyme Classification、ChEMBL Target Tree 和 Gene Ontology.
| "URI" | (必须的) | 化合物 URI 或者 URI 的 List | |
| "TargetOrganism" | None | ChEMBL 中的字母有机体 | |
| "TargetOrganismURI" | None | 来自 Uniprot 的有机体 URI |
来自目标的类成员列表
"TargetClassMembersList" — 在支持的结构中使用给定类别分类的目标列表. 目前支持的结构是 Enzyme 分类、ChEMBL 目标树和 Gene Ontology.
| "URI" | (必须的) | 化合物 URI 或者 URI 组成的 List | |
| "TargetOrganism" | None | ChEMBL 中的字面的有机体 | |
| "TargetOrganismURI" | None | 来自 Uniprot 的有机体 URI | |
| "StartIndex" | 1 | 起始索引 | |
| MaxItems | 10 | 返回的元素数目 | |
| "SortBy" | None | 按照预期变量排序 |
目标类型列表
路径信息
"PathwayInformation" — 单条路径的信息
| "URI" | (必须的) | 路径 URI |
来自路径的化合物列表
"PathwayCompounds" — 作为指定路径的一部分的化合物列表
| "URI" | (必须的) | 路径 URI |
路径有机体
"PathwayOrganisms" — 路径数据可用的有机体 URI 和标签列表
| "StartIndex" | 1 | 起始索引 | |
| MaxItems | 10 | 返回的元素数目 | |
| "SortBy" | None | 按照预期变量排序 |
按照相似度搜索
"StructureSearchBySimilarity" — 根据指定的算法和阈值，与输入分子相似的 ChemSpider 化合物 URL 集合
| "Molecule" | (必须的) | SMILES 字符串 | |
| "SimilarityType" | None | "Tanimoto"、"Tversky" 或者 "Euclidian" | |
| "Threshold" | None | 从 0 到 1 的实数 | |
| "Alpha" | None | 从 0 到 1 的实数（只对 Tversky 特性可用） | |
| "Beta" | None | 从 0 到 1 的实数（只对 Tversky 特性可用） | |
| "StartIndex" | 1 | 起始索引 | |
| MaxItems | 10 | 返回的元素数目 |
按照子结构搜索
"StructureSearchBySubstructure" — 包含指定结构的 ChemSpider 化合物 URL 集合
| "Molecule" | (必须的) | SMILES 字符串 | |
| "MolType" | None | "SMILES" 或者 "SMARTS" | |
| "StartIndex" | 1 | 起始索引 | |
| MaxItems | 10 | 返回的元素数目 |
参数细节
| "ChildNode" | 子结点 | |
| "CompoundName" | 化合物名称 | |
| "CWCompound" | cW 化合物 | |
| "Item" | 项目 | |
| "NodeURI" | 结点 URI | |
| "OCRSCompound" | OCRS 化合物 |
| "ChildNode" | 子结点 | |
| "Item" | 项目 | |
| "NodeURI" | 结点 URI | |
| "ChEMBLName" | ChEMBL 名称 | |
| "ChEMBLOrganism" | ChEMBL 有机体 | |
| "ChEMBLTarget" | ChEMBL 目标 | |
| "G" | G | |
| "G2" | G2 | |
| "IMSUniprotTargetURI" | IMS uniprot 目标 URI | |
| "Mapping" | 映射 | |
| "MappingDataset" | 映射数据集 | |
| "MappingName" | 映射名称 | |
| "MappingOrg" | 映射有机体 | |
| "MappingOrgURI" | 映射有机体 URI | |
| "MappingType" | 映射类型 | |
| "TargetType" | 目标类型 | |
| "UniprotName" | Uniprot 名称 | |
| "UniprotOrganism" | Uniprot 有机体 | |
| "UniprotTarget" | Uniprot 目标 |
| "Count" | 数目 | |
| "Item" | 项目 | |
| "Label" | 标签 | |
| "Pathway" | 路径 |