MoleculePlot
MoleculePlot[mol]
分子 mol の二次元構造式を作る.
MoleculePlot[mol,patt]
パターン patt にマッチするすべての原子と結合がハイライトされた mol の構造式を作る.
詳細とオプション
- MoleculePlotはGraphics式を返す.
- 分子が構造式の座標を持っていない場合は,座標が自動的に生成される.
- mol は,Moleculeオブジェクト,または,体系的な化学名,"Chemical"実体,BioSequence,あるいはExternalIdentifierのように簡単に分子に変換できるものでよい.
- MoleculePlot[MoleculePattern[…]]は指定された分子パターンの描写を返す.
- 次は patt の可能な形である.
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n 特定の原子のインデックス Atom[…] 原子のパターン Bond[…] 結合のパターン MoleculePattern[…] 分子の下部構造のパターン {patt1,patt2,…} パターンのリスト <label1patt1,… > ラベルとパターンのAssociation - MoleculePlotには,Graphicsと同じオプションに以下の追加・変更を加えたものが使える. [全オプションのリスト]
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AtomLabels Automatic 原子のラベルとラベルの置き方 AtomLabelStyle Automatic 原子のラベルに使用するスタイル BondLabels None 結合のラベルとラベルの置き方 BondLabelStyle Automatic 結合のラベルに使用するスタイル ColorRules Automatic 原子要素にどの色を使うのかを指示する{elem1->col1,…}の形の規則のリスト IncludeHydrogens Automatic 水素原子を表示するかどうか PlotLegends None ハイライトの凡例 PlotTheme $PlotTheme プロットの全体的なテーマ - 以下は,サポートされるプロットテーマである.
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"AllAtom" すべての水素を表示する "Aromatic" 原子結合は破線または円で示される "HeavyAtom" 水素原子は省略されるか結合された重原子と組み合されるかする "Monochrome" すべてのテキストとグラフィックスを黒で示す - 次は,PlotLegendsのよく使われる設定である.
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None 凡例は使わない Automatic 凡例を自動的に決定する {lbl1,lbl2,…} lbl1, lbl2, …を凡例のラベルとして使う Placed[lspec,…] 凡例の置き方を指定する
全オプションのリスト
例題
すべて開くすべて閉じるオプション (7)
Wolfram Research (2019), MoleculePlot, Wolfram言語関数, https://reference.wolfram.com/language/ref/MoleculePlot.html (2021年に更新).
テキスト
Wolfram Research (2019), MoleculePlot, Wolfram言語関数, https://reference.wolfram.com/language/ref/MoleculePlot.html (2021年に更新).
CMS
Wolfram Language. 2019. "MoleculePlot." Wolfram Language & System Documentation Center. Wolfram Research. Last Modified 2021. https://reference.wolfram.com/language/ref/MoleculePlot.html.
APA
Wolfram Language. (2019). MoleculePlot. Wolfram Language & System Documentation Center. Retrieved from https://reference.wolfram.com/language/ref/MoleculePlot.html