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BioSequencePlot[bioseq]

生体分子配列 bioseq の二次元回路図を作成する．

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BioSequencePlot

BioSequencePlot[bioseq]

生体分子配列 bioseq の二次元回路図を作成する．

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例題

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例  (3)

生体分子配列を作成してプロットする：

Wolfram Language code: BioSequencePlot[BioSequence["DNA", "ATAATCTGT"]]

より高次の結び目を持つ生体分子配列をプロットする：

Wolfram Language code: BioSequencePlot[BioSequence["RNA", "GCCAGACUGAYAUCUGGA", {Bond[{2, 17}], Bond[{3, 16}], Bond[{4, 15}], Bond[{5, 14}], Bond[{6, 13}]}]]

ジスフィルド結合を持つ一連の環状ペプチドカラタB1をプロットする：

Wolfram Language code: BioSequencePlot[BioSequence["CircularPeptide", "GLPVCGETCVGGTCNTPGCTCSWPVCTRN", Bond /@ {{5, 19}, {9, 21}, {14, 26}}]]

スコープ  (5)

ハイブリッド鎖のモチーフは色の違いで識別できる：

Wolfram Language code: BioSequencePlot[BioSequence["HybridStrand", {BioSequence["DNA", "CAGT"], BioSequence["RNA", "GUA"]}, {Bond[{{1, 2}, {2, 2}}]}]]

複数の鎖はすべて一緒にプロットできる：

Wolfram Language code: BioSequencePlot[BioSequence[{BioSequence["HybridStrand", {BioSequence["DNA", "G"], BioSequence["DNA", "CCCC"], BioSequence["RNA", "G"], BioSequence["DNA", "TTTT"]}], BioSequence["HybridStrand", {BioSequence["DNA", "AAAAA"], BioSequence["RNA", "U"], BioSequence["DNA", "GGGGG"]}]}, {Bond[{{1, 2, 2}, {2, 3, 3}}], Bond[{{1, 2, 3}, {2, 3, 2}}], Bond[{{1, 4, 2}, {2, 1, 3}}], Bond[{{1, 4, 3}, {2, 1, 2}}]}]]

デフォルトで，配列が長くなると文字が表示されなくなるが，ツールチップで特徴情報が提供されるようになる：

Wolfram Language code: BioSequencePlot[BioSequence["DNA", "TTCCCCCTCTACGCGCCAGTAGGTCTAATAAAGCTACCTTCGTGACAATACTGCTGCTTTCTGCCTCCCTTGCAACGTAGAGGGTGCAGCCCGGTCGGCT", {}]]

より複雑で簡約された構造には理解を助けるためのツールチップが付けられる：

Wolfram Language code: BioSequencePlot[BioSequence[{BioSequence["HybridStrand", {BioSequence["DNA", "ATCG"], InputForm[BioSequence["DNA", "CCCCCC"]], InputForm[BioSequence["RNA", "AUCG"]], InputForm[BioSequence["DNA", "TTTTTT"]], BioSequence["RNA", 50]}], BioSequence["HybridStrand", {InputForm[BioSequence["DNA", "AAAAAA"]], InputForm[BioSequence["RNA", "UUUU"]], InputForm[BioSequence["DNA", "GGGGGG"]], BioSequence["RNA", "U"], BioSequence["RNA", 40]}]}, {Bond[{{1, 2, 2}, {2, 3, 5}}], Bond[{{1, 2, 3}, {2, 3, 4}}], Bond[{{1, 2, 4}, {2, 3, 3}}], Bond[{{1, 2, 5}, {2, 3, 2}}], Bond[{{1, 4, 2}, {2, 1, 5}}], Bond[{{1, 4, 3}, {2, 1, 4}}], Bond[{{1, 4, 4}, {2, 1, 3}}], Bond[{{1, 5, 5}, {2, 1, 2}}]}]]

非常に長い配列は，大きすぎるプロットが生成されないように範囲ごとにグループ化される：

Wolfram Language code: BioSequencePlot[BioSequence["RNA", StringRepeat["N", 1034], {Bond[{56, 718}], Bond[{143, 517}], Bond[{834, 1000}]} ] ]

おもしろい例題  (1)

繰り返されるRNAの擬似結び目は同じ構造がスケールを変えて描画される様子を示している：

Wolfram Language code: repeatedPseudoknot[n_] := BioSequencePlot[BioSequence["RNA", StringRepeat["GAUGGCACUCCCAUCAAUUGGAGC", n], StringRepeat["(((((..<<<))))).....>>>.", n]]]
Wolfram Language code: repeatedPseudoknot[1]
Wolfram Language code: repeatedPseudoknot[10]
Wolfram Language code: repeatedPseudoknot[200]
Wolfram Research (2021), BioSequencePlot, Wolfram言語関数， https://reference.wolfram.com/language/ref/BioSequencePlot.html.

テキスト

Wolfram Research (2021), BioSequencePlot, Wolfram言語関数， https://reference.wolfram.com/language/ref/BioSequencePlot.html.

CMS

Wolfram Language. 2021. "BioSequencePlot." Wolfram Language & System Documentation Center. Wolfram Research. https://reference.wolfram.com/language/ref/BioSequencePlot.html.

APA

Wolfram Language. (2021). BioSequencePlot. Wolfram Language & System Documentation Center. Retrieved from https://reference.wolfram.com/language/ref/BioSequencePlot.html

BibTeX

@misc{reference.wolfram_2026_biosequenceplot, author="Wolfram Research", title="{BioSequencePlot}", year="2021", howpublished="\url{https://reference.wolfram.com/language/ref/BioSequencePlot.html}", note=[Accessed: 11-August-2026]}

BibLaTeX

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